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Markers Found at ≥80% in Haplogroups (Ltr-Num-Ltr Level)

Data retrieved from sequences collected from Genbank on 2023-01-15
Number of unique variants below = 1553
Minimum haplogroup size for reporting = 10 sequences

There are twelve high frequency ancestral variants in this list that are extremely common across all lineages and, as such, are not generally informative for haplotyping. Conversely, the lack of one or more of these variants may be of use. These variants are 73G, 263G, 750G, 1438G, 2706G, 4769G, 7028T, 8860G, 11719A, 14766T, 15326G, & 16519C. For lineage distribution, see https://www.mitomap.org/MITOMAP/TopVariants.

Index	Pos	rCRS	Variant	Count	HG Total	Freq	Haplo
1	56	A	-	27	30	90.00	M39b
2	58	T	A	30	30	100.00	M39b
3	61	C	A	14	17	82.35	M13c
4	61	C	T	28	32	87.50	Q3a
5	62	G	A	14	17	82.35	M13c
6	62	G	A	28	32	87.50	Q3a
7	64	C	T	21	22	95.45	A2f
8	64	C	T	28	31	90.32	A2h
9	64	C	T	19	20	95.00	A2i
10	64	C	T	10	12	83.33	A2j
11	64	C	T	12	13	92.31	A2k
12	64	C	T	13	14	92.86	A2l
13	64	C	T	9	10	90.00	A2n
14	64	C	T	14	16	87.50	A2p
15	64	C	T	25	27	92.59	A2q
16	64	C	T	19	19	100.00	A2v
17	64	C	T	30	34	88.24	A2w
18	64	C	T	12	15	80.00	A2y
19	64	C	T	21	22	95.45	A8a
20	64	C	T	268	283	94.70	R0a
21	65	T	TT	28	30	93.33	M39b
22	66	G	T	30	30	100.00	M39b
23	72	T	C	82	86	95.35	HV0a
24	72	T	C	15	15	100.00	HV0b
25	72	T	C	13	15	86.67	HV0d
26	72	T	C	14	15	93.33	HV0e
27	72	T	C	12	13	92.31	V10a
28	72	T	C	13	15	86.67	V10b
29	72	T	C	12	14	85.71	V15a
30	72	T	C	14	15	93.33	V18a
31	72	T	C	103	126	81.75	V1a
32	72	T	C	15	17	88.24	V2b
33	72	T	C	9	11	81.82	V2c
34	72	T	C	17	18	94.44	V3a
35	72	T	C	72	86	83.72	V7a
36	72	T	G	15	15	100.00	H31a
37	73	A	G	23	23	100.00	A11a
38	73	A	G	13	13	100.00	A12a
39	73	A	G	13	13	100.00	A15a
40	73	A	G	56	56	100.00	A15c
41	73	A	G	13	13	100.00	A1a
42	73	A	G	243	291	83.51	A2a
43	73	A	G	46	46	100.00	A2b
44	73	A	G	27	31	87.10	A2d
45	73	A	G	21	22	95.45	A2f
46	73	A	G	16	18	88.89	A2g
47	73	A	G	28	31	90.32	A2h
48	73	A	G	19	20	95.00	A2i
49	73	A	G	11	12	91.67	A2j
50	73	A	G	13	13	100.00	A2k
51	73	A	G	14	14	100.00	A2l
52	73	A	G	12	12	100.00	A2m
53	73	A	G	9	10	90.00	A2n
54	73	A	G	15	16	93.75	A2p
55	73	A	G	26	27	96.30	A2q
56	73	A	G	11	11	100.00	A2u
57	73	A	G	19	19	100.00	A2v
58	73	A	G	34	34	100.00	A2w
59	73	A	G	14	15	93.33	A2y
60	73	A	G	70	70	100.00	A5a
61	73	A	G	25	25	100.00	A5b
62	73	A	G	10	10	100.00	A5c
63	73	A	G	22	22	100.00	A8a
64	73	A	G	62	65	95.38	B2a
65	73	A	G	241	243	99.18	B2b
66	73	A	G	52	54	96.30	B2c
67	73	A	G	35	35	100.00	B2d
68	73	A	G	34	35	97.14	B2e
69	73	A	G	15	16	93.75	B2g
70	73	A	G	11	11	100.00	B2h
71	73	A	G	34	34	100.00	B2i
72	73	A	G	19	19	100.00	B2l
73	73	A	G	30	30	100.00	B2o
74	73	A	G	25	25	100.00	B2q
75	73	A	G	16	17	94.12	B2y
76	73	A	G	2241	2247	99.73	B4a
77	73	A	G	284	288	98.61	B4b
78	73	A	G	294	296	99.32	B4c
79	73	A	G	42	42	100.00	B4d
80	73	A	G	22	22	100.00	B4e
81	73	A	G	47	48	97.92	B4g
82	73	A	G	18	18	100.00	B4h
83	73	A	G	11	11	100.00	B4i
84	73	A	G	539	539	100.00	B5a
85	73	A	G	169	170	99.41	B5b
86	73	A	G	71	72	98.61	B6a
87	73	A	G	153	157	97.45	C1b
88	73	A	G	61	68	89.71	C1c
89	73	A	G	156	158	98.73	C1d
90	73	A	G	448	451	99.33	C4a
91	73	A	G	231	231	100.00	C4b
92	73	A	G	31	35	88.57	C4c
93	73	A	G	71	71	100.00	C5a
94	73	A	G	44	44	100.00	C5b
95	73	A	G	34	36	94.44	C5c
96	73	A	G	33	34	97.06	C5d
97	73	A	G	159	160	99.38	C7a
98	73	A	G	22	27	81.48	D1a
99	73	A	G	18	19	94.74	D1e
100	73	A	G	51	53	96.23	D1f
101	73	A	G	36	36	100.00	D1g
102	73	A	G	36	37	97.30	D1j
103	73	A	G	65	65	100.00	D2a
104	73	A	G	22	22	100.00	D2b
105	73	A	G	174	175	99.43	D4a
106	73	A	G	294	297	98.99	D4b
107	73	A	G	81	81	100.00	D4c
108	73	A	G	185	186	99.46	D4e
109	73	A	G	17	18	94.44	D4f
110	73	A	G	86	87	98.85	D4g
111	73	A	G	125	125	100.00	D4h
112	73	A	G	46	46	100.00	D4i
113	73	A	G	314	317	99.05	D4j
114	73	A	G	39	39	100.00	D4m
115	73	A	G	18	18	100.00	D4n
116	73	A	G	59	59	100.00	D4o
117	73	A	G	12	12	100.00	D4p
118	73	A	G	27	27	100.00	D4q
119	73	A	G	13	13	100.00	D4s
120	73	A	G	227	229	99.13	D5a
121	73	A	G	164	166	98.80	D5b
122	73	A	G	24	24	100.00	D5c
123	73	A	G	19	19	100.00	D6a
124	73	A	G	13	13	100.00	D6c
125	73	A	G	381	385	98.96	E1a
126	73	A	G	53	53	100.00	E2a
127	73	A	G	32	32	100.00	E2b
128	73	A	G	744	750	99.20	F1a
129	73	A	G	153	154	99.35	F1b
130	73	A	G	60	60	100.00	F1c
131	73	A	G	72	72	100.00	F1d
132	73	A	G	32	32	100.00	F1e
133	73	A	G	151	151	100.00	F1f
134	73	A	G	84	84	100.00	F1g
135	73	A	G	71	71	100.00	F2a
136	73	A	G	30	30	100.00	F2b
137	73	A	G	13	13	100.00	F2c
138	73	A	G	18	18	100.00	F2d
139	73	A	G	11	11	100.00	F2f
140	73	A	G	79	79	100.00	F3a
141	73	A	G	230	231	99.57	F3b
142	73	A	G	35	35	100.00	F4a
143	73	A	G	72	73	98.63	F4b
144	73	A	G	81	81	100.00	G1a
145	73	A	G	68	68	100.00	G1b
146	73	A	G	15	15	100.00	G1c
147	73	A	G	268	271	98.89	G2a
148	73	A	G	56	56	100.00	G2b
149	73	A	G	10	10	100.00	G2c
150	73	A	G	42	44	95.45	G3a
151	73	A	G	18	18	100.00	G3b
152	73	A	G	55	55	100.00	HV2a
153	73	A	G	192	197	97.46	I1a
154	73	A	G	41	41	100.00	I1b
155	73	A	G	19	19	100.00	I1c
156	73	A	G	21	21	100.00	I1f
157	73	A	G	31	35	88.57	I2a
158	73	A	G	42	42	100.00	I2c
159	73	A	G	20	21	95.24	I2d
160	73	A	G	41	42	97.62	I3a
161	73	A	G	12	12	100.00	I3d
162	73	A	G	132	133	99.25	I4a
163	73	A	G	13	13	100.00	I4b
164	73	A	G	71	72	98.61	I5a
165	73	A	G	23	24	95.83	I5c
166	73	A	G	454	457	99.34	J1b
167	73	A	G	1596	1634	97.67	J1c
168	73	A	G	105	106	99.06	J1d
169	73	A	G	349	354	98.59	J2a
170	73	A	G	370	373	99.20	J2b
171	73	A	G	1213	1252	96.88	K1a
172	73	A	G	204	209	97.61	K1b
173	73	A	G	263	267	98.50	K1c
174	73	A	G	11	12	91.67	K1d
175	73	A	G	257	268	95.90	K2a
176	73	A	G	98	104	94.23	K2b
177	73	A	G	803	811	99.01	L0d
178	73	A	G	120	120	100.00	L0k
179	73	A	G	317	336	94.35	L1b
180	73	A	G	593	613	96.74	L1c
181	73	A	G	1083	1122	96.52	L2a
182	73	A	G	126	133	94.74	L2b
183	73	A	G	148	152	97.37	L2c
184	73	A	G	25	27	92.59	L2d
185	73	A	G	19	21	90.48	L2e
186	73	A	G	30	30	100.00	L3a
187	73	A	G	412	428	96.26	L3b
188	73	A	G	412	429	96.04	L3d
189	73	A	G	936	966	96.89	L3e
190	73	A	G	284	286	99.30	L3f
191	73	A	G	67	72	93.06	L3h
192	73	A	G	34	37	91.89	L3i
193	73	A	G	20	21	95.24	L3k
194	73	A	G	41	41	100.00	L3x
195	73	A	G	19	20	95.00	L4a
196	73	A	G	89	92	96.74	L4b
197	73	A	G	28	30	93.33	L5a
198	73	A	G	65	65	100.00	M10a
199	73	A	G	21	21	100.00	M11a
200	73	A	G	9	10	90.00	M11b
201	73	A	G	65	65	100.00	M12a
202	73	A	G	44	44	100.00	M12b
203	73	A	G	41	41	100.00	M13a
204	73	A	G	13	13	100.00	M13b
205	73	A	G	17	17	100.00	M13c
206	73	A	G	20	20	100.00	M17a
207	73	A	G	38	38	100.00	M17c
208	73	A	G	18	18	100.00	M18a
209	73	A	G	183	186	98.39	M1a
210	73	A	G	34	34	100.00	M1b
211	73	A	G	33	33	100.00	M21a
212	73	A	G	49	49	100.00	M21b
213	73	A	G	24	25	96.00	M24a
214	73	A	G	18	18	100.00	M24b
215	73	A	G	49	49	100.00	M27a
216	73	A	G	66	66	100.00	M27b
217	73	A	G	29	29	100.00	M27c
218	73	A	G	56	56	100.00	M28a
219	73	A	G	131	132	99.24	M2a
220	73	A	G	102	103	99.03	M2b
221	73	A	G	10	10	100.00	M30b
222	73	A	G	14	14	100.00	M30c
223	73	A	G	14	14	100.00	M30d
224	73	A	G	24	24	100.00	M31a
225	73	A	G	10	10	100.00	M32a
226	73	A	G	152	153	99.35	M32c
227	73	A	G	42	42	100.00	M33a
228	73	A	G	18	18	100.00	M33b
229	73	A	G	21	21	100.00	M33c
230	73	A	G	32	32	100.00	M35a
231	73	A	G	57	59	96.61	M35b
232	73	A	G	27	28	96.43	M36d
233	73	A	G	10	11	90.91	M37e
234	73	A	G	30	30	100.00	M39b
235	73	A	G	88	89	98.88	M3a
236	73	A	G	47	47	100.00	M3c
237	73	A	G	29	29	100.00	M3d
238	73	A	G	28	28	100.00	M40a
239	73	A	G	21	23	91.30	M42a
240	73	A	G	17	18	94.44	M42b
241	73	A	G	11	11	100.00	M44a
242	73	A	G	19	19	100.00	M45a
243	73	A	G	16	16	100.00	M49a
244	73	A	G	14	14	100.00	M49c
245	73	A	G	16	16	100.00	M4a
246	73	A	G	13	13	100.00	M50a
247	73	A	G	42	43	97.67	M51a
248	73	A	G	32	32	100.00	M52a
249	73	A	G	20	20	100.00	M52b
250	73	A	G	24	24	100.00	M53b
251	73	A	G	155	158	98.10	M5a
252	73	A	G	29	29	100.00	M5b
253	73	A	G	17	18	94.44	M5c
254	73	A	G	10	10	100.00	M60a
255	73	A	G	18	18	100.00	M62b
256	73	A	G	26	27	96.30	M65a
257	73	A	G	25	25	100.00	M68a
258	73	A	G	13	13	100.00	M69a
259	73	A	G	21	21	100.00	M6a
260	73	A	G	43	44	97.73	M71a
261	73	A	G	15	15	100.00	M72a
262	73	A	G	32	32	100.00	M74a
263	73	A	G	66	66	100.00	M74b
264	73	A	G	105	106	99.06	M7a
265	73	A	G	667	670	99.55	M7b
266	73	A	G	783	788	99.37	M7c
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1264	263	A	G	1200	1245	96.39	U5b
1265	263	A	G	279	282	98.94	U6a
1266	263	A	G	48	49	97.96	U6b
1267	263	A	G	14	14	100.00	U6c
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1270	263	A	G	119	119	100.00	U7b
1271	263	A	G	101	108	93.52	U8a
1272	263	A	G	56	58	96.55	U8b
1273	263	A	G	10	10	100.00	U9a
1274	263	A	G	13	13	100.00	V10a
1275	263	A	G	15	15	100.00	V10b
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1277	263	A	G	14	15	93.33	V18a
1278	263	A	G	113	126	89.68	V1a
1279	263	A	G	17	17	100.00	V2b
1280	263	A	G	10	11	90.91	V2c
1281	263	A	G	18	18	100.00	V3a
1282	263	A	G	16	16	100.00	V3c
1283	263	A	G	75	86	87.21	V7a
1284	263	A	G	27	27	100.00	V9a
1285	263	A	G	41	44	93.18	W1a
1286	263	A	G	24	26	92.31	W1b
1287	263	A	G	23	25	92.00	W1c
1288	263	A	G	22	24	91.67	W1e
1289	263	A	G	98	104	94.23	W3a
1290	263	A	G	42	42	100.00	W3b
1291	263	A	G	18	19	94.74	W4a
1292	263	A	G	40	44	90.91	W5a
1293	263	A	G	29	30	96.67	W6a
1294	263	A	G	39	39	100.00	X2a
1295	263	A	G	255	261	97.70	X2b
1296	263	A	G	101	107	94.39	X2c
1297	263	A	G	25	25	100.00	X2d
1298	263	A	G	55	56	98.21	X2e
1299	263	A	G	12	12	100.00	X2f
1300	263	A	G	22	22	100.00	X2i
1301	263	A	G	18	18	100.00	X2m
1302	263	A	G	15	15	100.00	X3a
1303	263	A	G	121	122	99.18	Y1a
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5943	8860	A	G	12	12	100.00	K1d
5944	8860	A	G	266	268	99.25	K2a
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9013	14766	C	T	49	49	100.00	N9b
9014	14766	C	T	146	147	99.32	P1d
9015	14766	C	T	18	18	100.00	P3b
9016	14766	C	T	36	36	100.00	P4a
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9018	14766	C	T	128	128	100.00	Q1a
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9481	15257	G	A	370	373	99.20	J2b
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9483	15261	G	A	90	91	98.90	Z1a
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