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Markers Found at ≥80% in Haplogroups (Ltr-Num-Ltr Level)

Data retrieved from sequences collected from Genbank on 2020-01-01
Number of unique variants below = 1504
Minimum haplogroup size for reporting = 10 sequences

There are twelve high frequency ancestral variants in this list that are extremely common across all lineages and, as such, are not generally informative for haplotyping. Conversely, the lack of one or more of these variants may be of use. These variants are 73G, 263G, 750G, 1438G, 2706G, 4769G, 7028T, 8860G, 11719A, 14766T, 15326G, & 16519C. For lineage distribution, see https://www.mitomap.org/MITOMAP/TopVariants.

Index	Pos	rCRS	Variant	Count	HG Total	Freq	Haplo
1	55	T	C	51	63	80.95	H15a
2	56	A	-	17	19	89.47	M39b
3	57	T	G	36	45	80.00	D1a
4	58	T	A	19	19	100.00	M39b
5	63	T	C	20	20	100.00	M74a
6	64	C	T	18	19	94.74	A2f
7	64	C	T	15	17	88.24	A2h
8	64	C	T	16	17	94.12	A2i
9	64	C	T	8	10	80.00	A2j
10	64	C	T	12	13	92.31	A2l
11	64	C	T	13	14	92.86	A2p
12	64	C	T	17	19	89.47	A2q
13	64	C	T	11	11	100.00	A2v
14	64	C	T	12	15	80.00	A2y
15	64	C	T	15	16	93.75	A8a
16	64	C	T	18	20	90.00	M74a
17	64	C	T	246	257	95.72	R0a
18	65	T	TT	17	19	89.47	M39b
19	66	G	A	20	20	100.00	M74a
20	66	G	T	19	19	100.00	M39b
21	70	G	A	37	45	82.22	D1a
22	72	T	C	80	82	97.56	HV0a
23	72	T	C	11	13	84.62	HV0d
24	72	T	C	14	15	93.33	HV0e
25	72	T	C	10	11	90.91	V10a
26	72	T	C	12	13	92.31	V10b
27	72	T	C	12	14	85.71	V15a
28	72	T	C	12	13	92.31	V18a
29	72	T	C	13	14	92.86	V2b
30	72	T	C	8	10	80.00	V2c
31	72	T	C	69	80	86.25	V7a
32	72	T	G	13	13	100.00	H31a
33	73	A	G	23	23	100.00	A11a
34	73	A	G	10	10	100.00	A11b
35	73	A	G	10	10	100.00	A12a
36	73	A	G	10	10	100.00	A15a
37	73	A	G	54	54	100.00	A15c
38	73	A	G	12	12	100.00	A1a
39	73	A	G	204	226	90.27	A2a
40	73	A	G	43	43	100.00	A2b
41	73	A	G	21	25	84.00	A2d
42	73	A	G	18	19	94.74	A2f
43	73	A	G	11	13	84.62	A2g
44	73	A	G	15	17	88.24	A2h
45	73	A	G	16	17	94.12	A2i
46	73	A	G	9	10	90.00	A2j
47	73	A	G	13	13	100.00	A2l
48	73	A	G	12	12	100.00	A2m
49	73	A	G	13	14	92.86	A2p
50	73	A	G	18	19	94.74	A2q
51	73	A	G	11	11	100.00	A2u
52	73	A	G	11	11	100.00	A2v
53	73	A	G	22	22	100.00	A2w
54	73	A	G	14	15	93.33	A2y
55	73	A	G	66	66	100.00	A5a
56	73	A	G	25	25	100.00	A5b
57	73	A	G	16	16	100.00	A8a
58	73	A	G	44	47	93.62	B2a
59	73	A	G	189	191	98.95	B2b
60	73	A	G	44	46	95.65	B2c
61	73	A	G	12	12	100.00	B2d
62	73	A	G	35	36	97.22	B2e
63	73	A	G	14	15	93.33	B2g
64	73	A	G	33	33	100.00	B2i
65	73	A	G	14	14	100.00	B2l
66	73	A	G	27	27	100.00	B2o
67	73	A	G	21	21	100.00	B2q
68	73	A	G	13	14	92.86	B2y
69	73	A	G	2033	2039	99.71	B4a
70	73	A	G	259	262	98.85	B4b
71	73	A	G	266	268	99.25	B4c
72	73	A	G	32	32	100.00	B4d
73	73	A	G	14	14	100.00	B4e
74	73	A	G	35	36	97.22	B4g
75	73	A	G	17	17	100.00	B4h
76	73	A	G	11	11	100.00	B4i
77	73	A	G	473	473	100.00	B5a
78	73	A	G	153	154	99.35	B5b
79	73	A	G	65	65	100.00	B6a
80	73	A	G	122	126	96.83	C1b
81	73	A	G	52	59	88.14	C1c
82	73	A	G	118	120	98.33	C1d
83	73	A	G	398	399	99.75	C4a
84	73	A	G	208	208	100.00	C4b
85	73	A	G	30	33	90.91	C4c
86	73	A	G	69	69	100.00	C5a
87	73	A	G	41	41	100.00	C5b
88	73	A	G	21	23	91.30	C5c
89	73	A	G	31	32	96.88	C5d
90	73	A	G	148	149	99.33	C7a
91	73	A	G	40	45	88.89	D1a
92	73	A	G	32	33	96.97	D1e
93	73	A	G	49	51	96.08	D1f
94	73	A	G	28	28	100.00	D1g
95	73	A	G	21	21	100.00	D1j
96	73	A	G	63	63	100.00	D2a
97	73	A	G	15	15	100.00	D2b
98	73	A	G	154	155	99.35	D4a
99	73	A	G	244	246	99.19	D4b
100	73	A	G	81	81	100.00	D4c
101	73	A	G	153	153	100.00	D4e
102	73	A	G	16	16	100.00	D4f
103	73	A	G	80	81	98.77	D4g
104	73	A	G	116	116	100.00	D4h
105	73	A	G	48	48	100.00	D4i
106	73	A	G	249	249	100.00	D4j
107	73	A	G	32	32	100.00	D4m
108	73	A	G	15	15	100.00	D4n
109	73	A	G	53	53	100.00	D4o
110	73	A	G	26	26	100.00	D4q
111	73	A	G	13	13	100.00	D4s
112	73	A	G	216	218	99.08	D5a
113	73	A	G	149	150	99.33	D5b
114	73	A	G	18	18	100.00	D5c
115	73	A	G	18	18	100.00	D6a
116	73	A	G	12	12	100.00	D6c
117	73	A	G	368	372	98.92	E1a
118	73	A	G	49	49	100.00	E2a
119	73	A	G	32	32	100.00	E2b
120	73	A	G	668	673	99.26	F1a
121	73	A	G	139	139	100.00	F1b
122	73	A	G	47	47	100.00	F1c
123	73	A	G	47	47	100.00	F1d
124	73	A	G	30	30	100.00	F1e
125	73	A	G	132	132	100.00	F1f
126	73	A	G	44	44	100.00	F1g
127	73	A	G	65	65	100.00	F2a
128	73	A	G	24	24	100.00	F2b
129	73	A	G	14	14	100.00	F2c
130	73	A	G	15	15	100.00	F2d
131	73	A	G	69	69	100.00	F3a
132	73	A	G	225	226	99.56	F3b
133	73	A	G	32	32	100.00	F4a
134	73	A	G	73	74	98.65	F4b
135	73	A	G	69	69	100.00	G1a
136	73	A	G	33	33	100.00	G1b
137	73	A	G	219	220	99.55	G2a
138	73	A	G	44	44	100.00	G2b
139	73	A	G	28	29	96.55	G3a
140	73	A	G	18	18	100.00	G3b
141	73	A	G	37	37	100.00	HV2a
142	73	A	G	157	162	96.91	I1a
143	73	A	G	37	37	100.00	I1b
144	73	A	G	14	14	100.00	I1c
145	73	A	G	21	21	100.00	I1f
146	73	A	G	22	26	84.62	I2a
147	73	A	G	15	15	100.00	I2c
148	73	A	G	20	21	95.24	I2d
149	73	A	G	35	36	97.22	I3a
150	73	A	G	12	12	100.00	I3d
151	73	A	G	93	94	98.94	I4a
152	73	A	G	11	11	100.00	I4b
153	73	A	G	65	66	98.48	I5a
154	73	A	G	21	22	95.45	I5c
155	73	A	G	368	370	99.46	J1b
156	73	A	G	1220	1256	97.13	J1c
157	73	A	G	97	98	98.98	J1d
158	73	A	G	323	328	98.48	J2a
159	73	A	G	333	336	99.11	J2b
160	73	A	G	1033	1071	96.45	K1a
161	73	A	G	174	178	97.75	K1b
162	73	A	G	222	226	98.23	K1c
163	73	A	G	11	12	91.67	K1d
164	73	A	G	204	215	94.88	K2a
165	73	A	G	78	83	93.98	K2b
166	73	A	G	815	823	99.03	L0d
167	73	A	G	121	121	100.00	L0k
168	73	A	G	273	292	93.49	L1b
169	73	A	G	566	586	96.59	L1c
170	73	A	G	1013	1051	96.38	L2a
171	73	A	G	97	104	93.27	L2b
172	73	A	G	118	122	96.72	L2c
173	73	A	G	20	22	90.91	L2d
174	73	A	G	15	17	88.24	L2e
175	73	A	G	29	29	100.00	L3a
176	73	A	G	380	396	95.96	L3b
177	73	A	G	382	399	95.74	L3d
178	73	A	G	850	879	96.70	L3e
179	73	A	G	256	258	99.22	L3f
180	73	A	G	67	72	93.06	L3h
181	73	A	G	34	37	91.89	L3i
182	73	A	G	17	18	94.44	L3k
183	73	A	G	40	40	100.00	L3x
184	73	A	G	18	19	94.74	L4a
185	73	A	G	83	86	96.51	L4b
186	73	A	G	29	31	93.55	L5a
187	73	A	G	51	51	100.00	M10a
188	73	A	G	23	23	100.00	M11a
189	73	A	G	9	10	90.00	M11b
190	73	A	G	62	62	100.00	M12a
191	73	A	G	43	43	100.00	M12b
192	73	A	G	39	39	100.00	M13a
193	73	A	G	13	13	100.00	M13b
194	73	A	G	13	13	100.00	M13c
195	73	A	G	20	20	100.00	M17a
196	73	A	G	40	40	100.00	M17c
197	73	A	G	13	13	100.00	M18a
198	73	A	G	166	169	98.22	M1a
199	73	A	G	30	30	100.00	M1b
200	73	A	G	33	33	100.00	M21a
201	73	A	G	48	48	100.00	M21b
202	73	A	G	24	25	96.00	M24a
203	73	A	G	18	18	100.00	M24b
204	73	A	G	48	48	100.00	M27a
205	73	A	G	63	63	100.00	M27b
206	73	A	G	31	31	100.00	M27c
207	73	A	G	54	54	100.00	M28a
208	73	A	G	129	130	99.23	M2a
209	73	A	G	101	102	99.02	M2b
210	73	A	G	12	12	100.00	M30d
211	73	A	G	24	24	100.00	M31a
212	73	A	G	10	10	100.00	M32a
213	73	A	G	152	153	99.35	M32c
214	73	A	G	40	40	100.00	M33a
215	73	A	G	18	18	100.00	M33b
216	73	A	G	21	21	100.00	M33c
217	73	A	G	28	28	100.00	M35a
218	73	A	G	55	57	96.49	M35b
219	73	A	G	27	28	96.43	M36d
220	73	A	G	19	19	100.00	M39b
221	73	A	G	80	81	98.77	M3a
222	73	A	G	46	46	100.00	M3c
223	73	A	G	27	27	100.00	M3d
224	73	A	G	28	28	100.00	M40a
225	73	A	G	21	23	91.30	M42a
226	73	A	G	17	18	94.44	M42b
227	73	A	G	11	11	100.00	M44a
228	73	A	G	19	19	100.00	M45a
229	73	A	G	16	16	100.00	M49a
230	73	A	G	12	12	100.00	M49c
231	73	A	G	17	17	100.00	M4a
232	73	A	G	13	13	100.00	M50a
233	73	A	G	45	46	97.83	M51a
234	73	A	G	29	29	100.00	M52a
235	73	A	G	14	14	100.00	M52b
236	73	A	G	23	23	100.00	M53b
237	73	A	G	129	132	97.73	M5a
238	73	A	G	28	28	100.00	M5b
239	73	A	G	16	17	94.12	M5c
240	73	A	G	10	10	100.00	M60a
241	73	A	G	18	18	100.00	M62b
242	73	A	G	23	24	95.83	M65a
243	73	A	G	10	10	100.00	M65b
244	73	A	G	23	23	100.00	M68a
245	73	A	G	13	13	100.00	M69a
246	73	A	G	21	21	100.00	M6a
247	73	A	G	42	43	97.67	M71a
248	73	A	G	15	15	100.00	M72a
249	73	A	G	20	20	100.00	M74a
250	73	A	G	56	56	100.00	M74b
251	73	A	G	100	101	99.01	M7a
252	73	A	G	636	639	99.53	M7b
253	73	A	G	742	747	99.33	M7c
254	73	A	G	87	89	97.75	M8a
255	73	A	G	18	18	100.00	M91a
256	73	A	G	308	309	99.68	M9a
257	73	A	G	14	14	100.00	N10a
258	73	A	G	15	15	100.00	N11b
259	73	A	G	157	159	98.74	N1a
260	73	A	G	138	140	98.57	N1b
261	73	A	G	11	11	100.00	N21a
262	73	A	G	11	11	100.00	N2a
263	73	A	G	18	18	100.00	N3a
264	73	A	G	280	282	99.29	N9a
265	73	A	G	43	43	100.00	N9b
266	73	A	G	27	28	96.43	P1d
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1039	263	A	G	221	226	97.79	K1c
1040	263	A	G	11	12	91.67	K1d
1041	263	A	G	206	215	95.81	K2a
1042	263	A	G	78	83	93.98	K2b
1043	263	A	G	673	692	97.25	L0a
1044	263	A	G	48	50	96.00	L0f
1045	263	A	G	10	10	100.00	L0g
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1047	263	A	G	566	586	96.59	L1c
1048	263	A	G	1012	1051	96.29	L2a
1049	263	A	G	96	104	92.31	L2b
1050	263	A	G	118	122	96.72	L2c
1051	263	A	G	20	22	90.91	L2d
1052	263	A	G	15	17	88.24	L2e
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2541	1438	A	G	41	42	97.62	U1b
2542	1438	A	G	21	21	100.00	U2a
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3270	3552	T	A	392	399	98.25	C4a
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6406	10398	A	G	17	17	100.00	M4a
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6410	10398	A	G	14	14	100.00	M52b
6411	10398	A	G	23	23	100.00	M53b
6412	10398	A	G	132	132	100.00	M5a
6413	10398	A	G	28	28	100.00	M5b
6414	10398	A	G	16	17	94.12	M5c
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6647	10688	G	A	584	586	99.66	L1c
6648	10688	G	A	31	31	100.00	L5a
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6883	11248	A	G	33	33	100.00	D1e
6884	11251	A	G	368	370	99.46	J1b
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7118	11719	G	A	98	98	100.00	J1d
7119	11719	G	A	327	328	99.70	J2a
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8526	14766	C	T	16	16	100.00	Q1a
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8761	14905	G	A	191	191	100.00	T2c
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