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Markers Found at ≥80% in Haplogroups (Ltr-Num-Ltr Level)

Data retrieved from sequences collected from Genbank on 2020-05-01
Number of unique variants below = 1527
Minimum haplogroup size for reporting = 10 sequences

There are twelve high frequency ancestral variants in this list that are extremely common across all lineages and, as such, are not generally informative for haplotyping. Conversely, the lack of one or more of these variants may be of use. These variants are 73G, 263G, 750G, 1438G, 2706G, 4769G, 7028T, 8860G, 11719A, 14766T, 15326G, & 16519C. For lineage distribution, see https://www.mitomap.org/MITOMAP/TopVariants.

Index	Pos	rCRS	Variant	Count	HG Total	Freq	Haplo
1	56	A	-	17	19	89.47	M39b
2	58	T	A	19	19	100.00	M39b
3	61	C	A	14	17	82.35	M13c
4	61	C	T	28	32	87.50	Q3a
5	62	G	A	14	17	82.35	M13c
6	62	G	A	28	32	87.50	Q3a
7	64	C	T	18	19	94.74	A2f
8	64	C	T	15	17	88.24	A2h
9	64	C	T	16	17	94.12	A2i
10	64	C	T	8	10	80.00	A2j
11	64	C	T	12	13	92.31	A2l
12	64	C	T	13	14	92.86	A2p
13	64	C	T	17	19	89.47	A2q
14	64	C	T	11	11	100.00	A2v
15	64	C	T	15	18	83.33	A2w
16	64	C	T	12	15	80.00	A2y
17	64	C	T	15	16	93.75	A8a
18	64	C	T	253	267	94.76	R0a
19	65	T	TT	17	19	89.47	M39b
20	66	G	T	19	19	100.00	M39b
21	72	T	C	79	81	97.53	HV0a
22	72	T	C	10	10	100.00	HV0b
23	72	T	C	11	13	84.62	HV0d
24	72	T	C	14	15	93.33	HV0e
25	72	T	C	10	11	90.91	V10a
26	72	T	C	12	13	92.31	V10b
27	72	T	C	12	14	85.71	V15a
28	72	T	C	13	14	92.86	V18a
29	72	T	C	95	118	80.51	V1a
30	72	T	C	13	14	92.86	V2b
31	72	T	C	8	10	80.00	V2c
32	72	T	C	11	12	91.67	V3a
33	72	T	C	69	82	84.15	V7a
34	72	T	G	13	13	100.00	H31a
35	73	A	G	23	23	100.00	A11a
36	73	A	G	10	10	100.00	A12a
37	73	A	G	10	10	100.00	A15a
38	73	A	G	53	53	100.00	A15c
39	73	A	G	10	10	100.00	A1a
40	73	A	G	198	220	90.00	A2a
41	73	A	G	43	43	100.00	A2b
42	73	A	G	21	25	84.00	A2d
43	73	A	G	18	19	94.74	A2f
44	73	A	G	11	13	84.62	A2g
45	73	A	G	15	17	88.24	A2h
46	73	A	G	16	17	94.12	A2i
47	73	A	G	9	10	90.00	A2j
48	73	A	G	13	13	100.00	A2l
49	73	A	G	13	14	92.86	A2p
50	73	A	G	18	19	94.74	A2q
51	73	A	G	11	11	100.00	A2u
52	73	A	G	11	11	100.00	A2v
53	73	A	G	18	18	100.00	A2w
54	73	A	G	14	15	93.33	A2y
55	73	A	G	66	66	100.00	A5a
56	73	A	G	23	23	100.00	A5b
57	73	A	G	16	16	100.00	A8a
58	73	A	G	44	47	93.62	B2a
59	73	A	G	189	191	98.95	B2b
60	73	A	G	44	46	95.65	B2c
61	73	A	G	12	12	100.00	B2d
62	73	A	G	28	29	96.55	B2e
63	73	A	G	14	15	93.33	B2g
64	73	A	G	33	33	100.00	B2i
65	73	A	G	14	14	100.00	B2l
66	73	A	G	25	25	100.00	B2o
67	73	A	G	21	21	100.00	B2q
68	73	A	G	13	14	92.86	B2y
69	73	A	G	2051	2057	99.71	B4a
70	73	A	G	261	264	98.86	B4b
71	73	A	G	271	273	99.27	B4c
72	73	A	G	33	33	100.00	B4d
73	73	A	G	22	22	100.00	B4e
74	73	A	G	43	44	97.73	B4g
75	73	A	G	16	16	100.00	B4h
76	73	A	G	11	11	100.00	B4i
77	73	A	G	534	534	100.00	B5a
78	73	A	G	152	153	99.35	B5b
79	73	A	G	71	72	98.61	B6a
80	73	A	G	122	126	96.83	C1b
81	73	A	G	48	55	87.27	C1c
82	73	A	G	116	118	98.31	C1d
83	73	A	G	403	404	99.75	C4a
84	73	A	G	215	215	100.00	C4b
85	73	A	G	30	33	90.91	C4c
86	73	A	G	64	64	100.00	C5a
87	73	A	G	41	41	100.00	C5b
88	73	A	G	34	36	94.44	C5c
89	73	A	G	29	30	96.67	C5d
90	73	A	G	153	154	99.35	C7a
91	73	A	G	22	27	81.48	D1a
92	73	A	G	18	19	94.74	D1e
93	73	A	G	48	50	96.00	D1f
94	73	A	G	28	28	100.00	D1g
95	73	A	G	21	21	100.00	D1j
96	73	A	G	63	63	100.00	D2a
97	73	A	G	15	15	100.00	D2b
98	73	A	G	151	152	99.34	D4a
99	73	A	G	247	249	99.20	D4b
100	73	A	G	78	78	100.00	D4c
101	73	A	G	172	172	100.00	D4e
102	73	A	G	16	16	100.00	D4f
103	73	A	G	77	78	98.72	D4g
104	73	A	G	114	114	100.00	D4h
105	73	A	G	43	43	100.00	D4i
106	73	A	G	280	281	99.64	D4j
107	73	A	G	32	32	100.00	D4m
108	73	A	G	15	15	100.00	D4n
109	73	A	G	56	56	100.00	D4o
110	73	A	G	10	10	100.00	D4p
111	73	A	G	26	26	100.00	D4q
112	73	A	G	13	13	100.00	D4s
113	73	A	G	209	211	99.05	D5a
114	73	A	G	150	152	98.68	D5b
115	73	A	G	22	22	100.00	D5c
116	73	A	G	18	18	100.00	D6a
117	73	A	G	13	13	100.00	D6c
118	73	A	G	373	377	98.94	E1a
119	73	A	G	49	49	100.00	E2a
120	73	A	G	32	32	100.00	E2b
121	73	A	G	712	717	99.30	F1a
122	73	A	G	136	137	99.27	F1b
123	73	A	G	45	45	100.00	F1c
124	73	A	G	46	46	100.00	F1d
125	73	A	G	30	30	100.00	F1e
126	73	A	G	146	146	100.00	F1f
127	73	A	G	74	74	100.00	F1g
128	73	A	G	68	68	100.00	F2a
129	73	A	G	27	27	100.00	F2b
130	73	A	G	12	12	100.00	F2c
131	73	A	G	14	14	100.00	F2d
132	73	A	G	76	76	100.00	F3a
133	73	A	G	224	225	99.56	F3b
134	73	A	G	31	31	100.00	F4a
135	73	A	G	73	74	98.65	F4b
136	73	A	G	79	79	100.00	G1a
137	73	A	G	68	68	100.00	G1b
138	73	A	G	13	13	100.00	G1c
139	73	A	G	219	220	99.55	G2a
140	73	A	G	49	49	100.00	G2b
141	73	A	G	10	10	100.00	G2c
142	73	A	G	32	34	94.12	G3a
143	73	A	G	18	18	100.00	G3b
144	73	A	G	38	38	100.00	HV2a
145	73	A	G	164	169	97.04	I1a
146	73	A	G	38	38	100.00	I1b
147	73	A	G	15	15	100.00	I1c
148	73	A	G	21	21	100.00	I1f
149	73	A	G	24	28	85.71	I2a
150	73	A	G	16	16	100.00	I2c
151	73	A	G	20	21	95.24	I2d
152	73	A	G	36	37	97.30	I3a
153	73	A	G	11	11	100.00	I3d
154	73	A	G	95	96	98.96	I4a
155	73	A	G	65	66	98.48	I5a
156	73	A	G	21	22	95.45	I5c
157	73	A	G	388	390	99.49	J1b
158	73	A	G	1281	1319	97.12	J1c
159	73	A	G	95	96	98.96	J1d
160	73	A	G	328	333	98.50	J2a
161	73	A	G	346	349	99.14	J2b
162	73	A	G	1065	1104	96.47	K1a
163	73	A	G	185	189	97.88	K1b
164	73	A	G	227	231	98.27	K1c
165	73	A	G	11	12	91.67	K1d
166	73	A	G	232	243	95.47	K2a
167	73	A	G	80	85	94.12	K2b
168	73	A	G	804	812	99.01	L0d
169	73	A	G	120	120	100.00	L0k
170	73	A	G	259	278	93.17	L1b
171	73	A	G	527	547	96.34	L1c
172	73	A	G	979	1017	96.26	L2a
173	73	A	G	95	102	93.14	L2b
174	73	A	G	113	117	96.58	L2c
175	73	A	G	22	24	91.67	L2d
176	73	A	G	15	17	88.24	L2e
177	73	A	G	29	29	100.00	L3a
178	73	A	G	374	390	95.90	L3b
179	73	A	G	376	393	95.67	L3d
180	73	A	G	837	866	96.65	L3e
181	73	A	G	251	253	99.21	L3f
182	73	A	G	65	70	92.86	L3h
183	73	A	G	34	37	91.89	L3i
184	73	A	G	17	18	94.44	L3k
185	73	A	G	41	41	100.00	L3x
186	73	A	G	19	20	95.00	L4a
187	73	A	G	86	89	96.63	L4b
188	73	A	G	27	29	93.10	L5a
189	73	A	G	50	50	100.00	M10a
190	73	A	G	20	20	100.00	M11a
191	73	A	G	9	10	90.00	M11b
192	73	A	G	61	61	100.00	M12a
193	73	A	G	44	44	100.00	M12b
194	73	A	G	39	39	100.00	M13a
195	73	A	G	13	13	100.00	M13b
196	73	A	G	17	17	100.00	M13c
197	73	A	G	20	20	100.00	M17a
198	73	A	G	38	38	100.00	M17c
199	73	A	G	16	16	100.00	M18a
200	73	A	G	171	174	98.28	M1a
201	73	A	G	29	29	100.00	M1b
202	73	A	G	33	33	100.00	M21a
203	73	A	G	49	49	100.00	M21b
204	73	A	G	24	25	96.00	M24a
205	73	A	G	18	18	100.00	M24b
206	73	A	G	49	49	100.00	M27a
207	73	A	G	66	66	100.00	M27b
208	73	A	G	29	29	100.00	M27c
209	73	A	G	56	56	100.00	M28a
210	73	A	G	128	129	99.22	M2a
211	73	A	G	101	102	99.02	M2b
212	73	A	G	11	11	100.00	M30c
213	73	A	G	12	12	100.00	M30d
214	73	A	G	24	24	100.00	M31a
215	73	A	G	10	10	100.00	M32a
216	73	A	G	152	153	99.35	M32c
217	73	A	G	40	40	100.00	M33a
218	73	A	G	18	18	100.00	M33b
219	73	A	G	21	21	100.00	M33c
220	73	A	G	31	31	100.00	M35a
221	73	A	G	55	57	96.49	M35b
222	73	A	G	27	28	96.43	M36d
223	73	A	G	10	11	90.91	M37e
224	73	A	G	19	19	100.00	M39b
225	73	A	G	67	68	98.53	M3a
226	73	A	G	45	45	100.00	M3c
227	73	A	G	29	29	100.00	M3d
228	73	A	G	28	28	100.00	M40a
229	73	A	G	21	23	91.30	M42a
230	73	A	G	17	18	94.44	M42b
231	73	A	G	11	11	100.00	M44a
232	73	A	G	19	19	100.00	M45a
233	73	A	G	16	16	100.00	M49a
234	73	A	G	13	13	100.00	M49c
235	73	A	G	15	15	100.00	M4a
236	73	A	G	13	13	100.00	M50a
237	73	A	G	42	43	97.67	M51a
238	73	A	G	29	29	100.00	M52a
239	73	A	G	14	14	100.00	M52b
240	73	A	G	23	23	100.00	M53b
241	73	A	G	126	129	97.67	M5a
242	73	A	G	28	28	100.00	M5b
243	73	A	G	16	17	94.12	M5c
244	73	A	G	10	10	100.00	M60a
245	73	A	G	18	18	100.00	M62b
246	73	A	G	21	22	95.45	M65a
247	73	A	G	23	23	100.00	M68a
248	73	A	G	13	13	100.00	M69a
249	73	A	G	21	21	100.00	M6a
250	73	A	G	42	43	97.67	M71a
251	73	A	G	14	14	100.00	M72a
252	73	A	G	32	32	100.00	M74a
253	73	A	G	64	64	100.00	M74b
254	73	A	G	101	102	99.02	M7a
255	73	A	G	632	635	99.53	M7b
256	73	A	G	738	743	99.33	M7c
257	73	A	G	87	89	97.75	M8a
258	73	A	G	18	18	100.00	M91a
259	73	A	G	306	308	99.35	M9a
260	73	A	G	15	15	100.00	N10a
261	73	A	G	15	15	100.00	N11b
262	73	A	G	163	165	98.79	N1a
263	73	A	G	145	148	97.97	N1b
264	73	A	G	11	11	100.00	N21a
265	73	A	G	11	11	100.00	N2a
266	73	A	G	18	18	100.00	N3a
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1015	263	A	G	10	10	100.00	H8a
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1035	263	A	G	20	21	95.24	I1f
1036	263	A	G	24	28	85.71	I2a
1037	263	A	G	16	16	100.00	I2c
1038	263	A	G	19	21	90.48	I2d
1039	263	A	G	36	37	97.30	I3a
1040	263	A	G	11	11	100.00	I3d
1041	263	A	G	89	96	92.71	I4a
1042	263	A	G	65	66	98.48	I5a
1043	263	A	G	21	22	95.45	I5c
1044	263	A	G	382	390	97.95	J1b
1045	263	A	G	1274	1319	96.59	J1c
1046	263	A	G	94	96	97.92	J1d
1047	263	A	G	325	333	97.60	J2a
1048	263	A	G	344	349	98.57	J2b
1049	263	A	G	1068	1104	96.74	K1a
1050	263	A	G	185	189	97.88	K1b
1051	263	A	G	226	231	97.84	K1c
1052	263	A	G	11	12	91.67	K1d
1053	263	A	G	233	243	95.88	K2a
1054	263	A	G	80	85	94.12	K2b
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2540	1438	A	G	15	15	100.00	N10a
2541	1438	A	G	15	15	100.00	N11b
2542	1438	A	G	164	165	99.39	N1a
2543	1438	A	G	146	148	98.65	N1b
2544	1438	A	G	11	11	100.00	N21a
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3268	3434	A	G	24	24	100.00	L2d
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3270	3447	A	G	18	18	100.00	M91a
3271	3450	C	T	389	390	99.74	L3b
3272	3480	A	G	1097	1104	99.37	K1a
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5201	8584	G	A	53	55	96.36	C1c
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8749	14766	C	T	16	16	100.00	Z4a
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8751	14769	A	G	204	253	80.63	L3f
8752	14770	C	T	14	14	100.00	V2b
8753	14783	T	C	126	126	100.00	C1b
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8755	14783	T	C	118	118	100.00	C1d
8756	14783	T	C	403	404	99.75	C4a
8757	14783	T	C	213	215	99.07	C4b
8758	14783	T	C	33	33	100.00	C4c
8759	14783	T	C	64	64	100.00	C5a
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8761	14783	T	C	36	36	100.00	C5c
8762	14783	T	C	30	30	100.00	C5d
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9241	15301	G	A	26	28	92.86	M5b
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