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Markers Found at ≥80% in Haplogroups (Ltr-Num-Ltr Level)

Data retrieved from sequences collected from Genbank on 2022-01-15
Number of unique variants below = 1539
Minimum haplogroup size for reporting = 10 sequences

There are twelve high frequency ancestral variants in this list that are extremely common across all lineages and, as such, are not generally informative for haplotyping. Conversely, the lack of one or more of these variants may be of use. These variants are 73G, 263G, 750G, 1438G, 2706G, 4769G, 7028T, 8860G, 11719A, 14766T, 15326G, & 16519C. For lineage distribution, see https://www.mitomap.org/MITOMAP/TopVariants.

Index	Pos	rCRS	Variant	Count	HG Total	Freq	Haplo
1	56	A	-	26	28	92.86	M39b
2	58	T	A	28	28	100.00	M39b
3	61	C	A	14	17	82.35	M13c
4	61	C	T	28	32	87.50	Q3a
5	62	G	A	14	17	82.35	M13c
6	62	G	A	28	32	87.50	Q3a
7	64	C	T	18	19	94.74	A2f
8	64	C	T	16	18	88.89	A2h
9	64	C	T	16	17	94.12	A2i
10	64	C	T	8	10	80.00	A2j
11	64	C	T	10	11	90.91	A2k
12	64	C	T	12	13	92.31	A2l
13	64	C	T	13	15	86.67	A2p
14	64	C	T	21	23	91.30	A2q
15	64	C	T	11	11	100.00	A2v
16	64	C	T	25	28	89.29	A2w
17	64	C	T	12	15	80.00	A2y
18	64	C	T	21	22	95.45	A8a
19	64	C	T	263	278	94.60	R0a
20	65	T	TT	26	28	92.86	M39b
21	66	G	T	28	28	100.00	M39b
22	72	T	C	81	83	97.59	HV0a
23	72	T	C	13	13	100.00	HV0b
24	72	T	C	12	14	85.71	HV0d
25	72	T	C	14	15	93.33	HV0e
26	72	T	C	10	11	90.91	V10a
27	72	T	C	12	14	85.71	V10b
28	72	T	C	12	14	85.71	V15a
29	72	T	C	14	15	93.33	V18a
30	72	T	C	100	123	81.30	V1a
31	72	T	C	13	15	86.67	V2b
32	72	T	C	8	10	80.00	V2c
33	72	T	C	16	17	94.12	V3a
34	72	T	C	70	83	84.34	V7a
35	72	T	G	13	13	100.00	H31a
36	73	A	G	23	23	100.00	A11a
37	73	A	G	12	12	100.00	A12a
38	73	A	G	13	13	100.00	A15a
39	73	A	G	54	54	100.00	A15c
40	73	A	G	12	12	100.00	A1a
41	73	A	G	223	271	82.29	A2a
42	73	A	G	46	46	100.00	A2b
43	73	A	G	21	25	84.00	A2d
44	73	A	G	18	19	94.74	A2f
45	73	A	G	11	13	84.62	A2g
46	73	A	G	16	18	88.89	A2h
47	73	A	G	16	17	94.12	A2i
48	73	A	G	9	10	90.00	A2j
49	73	A	G	11	11	100.00	A2k
50	73	A	G	13	13	100.00	A2l
51	73	A	G	14	15	93.33	A2p
52	73	A	G	22	23	95.65	A2q
53	73	A	G	11	11	100.00	A2u
54	73	A	G	11	11	100.00	A2v
55	73	A	G	28	28	100.00	A2w
56	73	A	G	14	15	93.33	A2y
57	73	A	G	66	66	100.00	A5a
58	73	A	G	23	23	100.00	A5b
59	73	A	G	10	10	100.00	A5c
60	73	A	G	22	22	100.00	A8a
61	73	A	G	44	47	93.62	B2a
62	73	A	G	232	234	99.15	B2b
63	73	A	G	44	46	95.65	B2c
64	73	A	G	34	34	100.00	B2d
65	73	A	G	30	31	96.77	B2e
66	73	A	G	14	15	93.33	B2g
67	73	A	G	33	33	100.00	B2i
68	73	A	G	19	19	100.00	B2l
69	73	A	G	26	26	100.00	B2o
70	73	A	G	24	24	100.00	B2q
71	73	A	G	15	16	93.75	B2y
72	73	A	G	2218	2224	99.73	B4a
73	73	A	G	274	278	98.56	B4b
74	73	A	G	279	281	99.29	B4c
75	73	A	G	35	35	100.00	B4d
76	73	A	G	22	22	100.00	B4e
77	73	A	G	46	47	97.87	B4g
78	73	A	G	18	18	100.00	B4h
79	73	A	G	11	11	100.00	B4i
80	73	A	G	537	537	100.00	B5a
81	73	A	G	165	166	99.40	B5b
82	73	A	G	71	72	98.61	B6a
83	73	A	G	132	136	97.06	C1b
84	73	A	G	49	56	87.50	C1c
85	73	A	G	143	145	98.62	C1d
86	73	A	G	440	441	99.77	C4a
87	73	A	G	224	224	100.00	C4b
88	73	A	G	30	33	90.91	C4c
89	73	A	G	69	69	100.00	C5a
90	73	A	G	43	43	100.00	C5b
91	73	A	G	34	36	94.44	C5c
92	73	A	G	31	32	96.88	C5d
93	73	A	G	155	156	99.36	C7a
94	73	A	G	22	27	81.48	D1a
95	73	A	G	18	19	94.74	D1e
96	73	A	G	50	52	96.15	D1f
97	73	A	G	36	36	100.00	D1g
98	73	A	G	36	37	97.30	D1j
99	73	A	G	64	64	100.00	D2a
100	73	A	G	18	18	100.00	D2b
101	73	A	G	159	160	99.38	D4a
102	73	A	G	273	275	99.27	D4b
103	73	A	G	79	79	100.00	D4c
104	73	A	G	181	181	100.00	D4e
105	73	A	G	16	16	100.00	D4f
106	73	A	G	81	82	98.78	D4g
107	73	A	G	118	118	100.00	D4h
108	73	A	G	43	43	100.00	D4i
109	73	A	G	302	303	99.67	D4j
110	73	A	G	34	34	100.00	D4m
111	73	A	G	18	18	100.00	D4n
112	73	A	G	57	57	100.00	D4o
113	73	A	G	12	12	100.00	D4p
114	73	A	G	27	27	100.00	D4q
115	73	A	G	13	13	100.00	D4s
116	73	A	G	218	220	99.09	D5a
117	73	A	G	159	161	98.76	D5b
118	73	A	G	24	24	100.00	D5c
119	73	A	G	18	18	100.00	D6a
120	73	A	G	13	13	100.00	D6c
121	73	A	G	375	379	98.94	E1a
122	73	A	G	49	49	100.00	E2a
123	73	A	G	32	32	100.00	E2b
124	73	A	G	732	738	99.19	F1a
125	73	A	G	144	145	99.31	F1b
126	73	A	G	50	50	100.00	F1c
127	73	A	G	47	47	100.00	F1d
128	73	A	G	31	31	100.00	F1e
129	73	A	G	149	149	100.00	F1f
130	73	A	G	79	79	100.00	F1g
131	73	A	G	70	70	100.00	F2a
132	73	A	G	27	27	100.00	F2b
133	73	A	G	13	13	100.00	F2c
134	73	A	G	14	14	100.00	F2d
135	73	A	G	10	10	100.00	F2f
136	73	A	G	78	78	100.00	F3a
137	73	A	G	225	226	99.56	F3b
138	73	A	G	34	34	100.00	F4a
139	73	A	G	74	75	98.67	F4b
140	73	A	G	82	82	100.00	G1a
141	73	A	G	68	68	100.00	G1b
142	73	A	G	15	15	100.00	G1c
143	73	A	G	252	253	99.60	G2a
144	73	A	G	50	50	100.00	G2b
145	73	A	G	10	10	100.00	G2c
146	73	A	G	37	39	94.87	G3a
147	73	A	G	18	18	100.00	G3b
148	73	A	G	53	53	100.00	HV2a
149	73	A	G	173	178	97.19	I1a
150	73	A	G	41	41	100.00	I1b
151	73	A	G	17	17	100.00	I1c
152	73	A	G	21	21	100.00	I1f
153	73	A	G	27	31	87.10	I2a
154	73	A	G	16	16	100.00	I2c
155	73	A	G	20	21	95.24	I2d
156	73	A	G	40	41	97.56	I3a
157	73	A	G	11	11	100.00	I3d
158	73	A	G	99	100	99.00	I4a
159	73	A	G	13	13	100.00	I4b
160	73	A	G	70	71	98.59	I5a
161	73	A	G	22	23	95.65	I5c
162	73	A	G	407	409	99.51	J1b
163	73	A	G	1371	1409	97.30	J1c
164	73	A	G	102	103	99.03	J1d
165	73	A	G	336	341	98.53	J2a
166	73	A	G	361	364	99.18	J2b
167	73	A	G	1127	1166	96.66	K1a
168	73	A	G	196	201	97.51	K1b
169	73	A	G	231	235	98.30	K1c
170	73	A	G	11	12	91.67	K1d
171	73	A	G	241	252	95.63	K2a
172	73	A	G	90	96	93.75	K2b
173	73	A	G	804	812	99.01	L0d
174	73	A	G	120	120	100.00	L0k
175	73	A	G	267	286	93.36	L1b
176	73	A	G	538	558	96.42	L1c
177	73	A	G	994	1033	96.22	L2a
178	73	A	G	95	102	93.14	L2b
179	73	A	G	116	120	96.67	L2c
180	73	A	G	22	24	91.67	L2d
181	73	A	G	15	17	88.24	L2e
182	73	A	G	29	29	100.00	L3a
183	73	A	G	381	397	95.97	L3b
184	73	A	G	377	394	95.69	L3d
185	73	A	G	851	880	96.70	L3e
186	73	A	G	258	260	99.23	L3f
187	73	A	G	65	70	92.86	L3h
188	73	A	G	34	37	91.89	L3i
189	73	A	G	17	18	94.44	L3k
190	73	A	G	41	41	100.00	L3x
191	73	A	G	19	20	95.00	L4a
192	73	A	G	88	91	96.70	L4b
193	73	A	G	27	29	93.10	L5a
194	73	A	G	52	52	100.00	M10a
195	73	A	G	20	20	100.00	M11a
196	73	A	G	9	10	90.00	M11b
197	73	A	G	63	63	100.00	M12a
198	73	A	G	44	44	100.00	M12b
199	73	A	G	41	41	100.00	M13a
200	73	A	G	13	13	100.00	M13b
201	73	A	G	17	17	100.00	M13c
202	73	A	G	20	20	100.00	M17a
203	73	A	G	38	38	100.00	M17c
204	73	A	G	16	16	100.00	M18a
205	73	A	G	178	181	98.34	M1a
206	73	A	G	33	33	100.00	M1b
207	73	A	G	33	33	100.00	M21a
208	73	A	G	49	49	100.00	M21b
209	73	A	G	24	25	96.00	M24a
210	73	A	G	18	18	100.00	M24b
211	73	A	G	49	49	100.00	M27a
212	73	A	G	66	66	100.00	M27b
213	73	A	G	29	29	100.00	M27c
214	73	A	G	56	56	100.00	M28a
215	73	A	G	130	131	99.24	M2a
216	73	A	G	102	103	99.03	M2b
217	73	A	G	10	10	100.00	M30b
218	73	A	G	13	13	100.00	M30c
219	73	A	G	14	14	100.00	M30d
220	73	A	G	24	24	100.00	M31a
221	73	A	G	10	10	100.00	M32a
222	73	A	G	152	153	99.35	M32c
223	73	A	G	42	42	100.00	M33a
224	73	A	G	18	18	100.00	M33b
225	73	A	G	21	21	100.00	M33c
226	73	A	G	31	31	100.00	M35a
227	73	A	G	56	58	96.55	M35b
228	73	A	G	27	28	96.43	M36d
229	73	A	G	10	11	90.91	M37e
230	73	A	G	28	28	100.00	M39b
231	73	A	G	86	87	98.85	M3a
232	73	A	G	45	45	100.00	M3c
233	73	A	G	29	29	100.00	M3d
234	73	A	G	28	28	100.00	M40a
235	73	A	G	21	23	91.30	M42a
236	73	A	G	17	18	94.44	M42b
237	73	A	G	11	11	100.00	M44a
238	73	A	G	19	19	100.00	M45a
239	73	A	G	16	16	100.00	M49a
240	73	A	G	13	13	100.00	M49c
241	73	A	G	16	16	100.00	M4a
242	73	A	G	13	13	100.00	M50a
243	73	A	G	42	43	97.67	M51a
244	73	A	G	31	31	100.00	M52a
245	73	A	G	20	20	100.00	M52b
246	73	A	G	23	23	100.00	M53b
247	73	A	G	134	137	97.81	M5a
248	73	A	G	28	28	100.00	M5b
249	73	A	G	17	18	94.44	M5c
250	73	A	G	10	10	100.00	M60a
251	73	A	G	18	18	100.00	M62b
252	73	A	G	26	27	96.30	M65a
253	73	A	G	25	25	100.00	M68a
254	73	A	G	13	13	100.00	M69a
255	73	A	G	21	21	100.00	M6a
256	73	A	G	42	43	97.67	M71a
257	73	A	G	14	14	100.00	M72a
258	73	A	G	32	32	100.00	M74a
259	73	A	G	65	65	100.00	M74b
260	73	A	G	105	106	99.06	M7a
261	73	A	G	642	645	99.53	M7b
262	73	A	G	753	758	99.34	M7c
263	73	A	G	90	92	97.83	M8a
264	73	A	G	18	18	100.00	M91a
265	73	A	G	310	312	99.36	M9a
266	73	A	G	16	16	100.00	N10a
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3997	4769	A	G	14	14	100.00	M72a
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3999	4769	A	G	65	65	100.00	M74b
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7596	11869	C	A	89	96	92.71	K2b
7597	11881	C	T	29	29	100.00	L5a
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