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Markers Found at ≥80% in Haplogroups (Ltr-Num-Ltr Level)

Data retrieved from sequences collected from Genbank on 2022-07-01
Number of unique variants below = 1550
Minimum haplogroup size for reporting = 10 sequences

There are twelve high frequency ancestral variants in this list that are extremely common across all lineages and, as such, are not generally informative for haplotyping. Conversely, the lack of one or more of these variants may be of use. These variants are 73G, 263G, 750G, 1438G, 2706G, 4769G, 7028T, 8860G, 11719A, 14766T, 15326G, & 16519C. For lineage distribution, see https://www.mitomap.org/MITOMAP/TopVariants.

Index	Pos	rCRS	Variant	Count	HG Total	Freq	Haplo
1	56	A	-	26	29	89.66	M39b
2	58	T	A	29	29	100.00	M39b
3	61	C	A	14	17	82.35	M13c
4	61	C	T	29	33	87.88	Q3a
5	62	G	A	14	17	82.35	M13c
6	62	G	A	29	33	87.88	Q3a
7	64	C	T	18	19	94.74	A2f
8	64	C	T	16	19	84.21	A2h
9	64	C	T	16	17	94.12	A2i
10	64	C	T	8	10	80.00	A2j
11	64	C	T	10	11	90.91	A2k
12	64	C	T	12	13	92.31	A2l
13	64	C	T	13	15	86.67	A2p
14	64	C	T	22	24	91.67	A2q
15	64	C	T	11	11	100.00	A2v
16	64	C	T	25	28	89.29	A2w
17	64	C	T	12	15	80.00	A2y
18	64	C	T	21	22	95.45	A8a
19	64	C	T	264	279	94.62	R0a
20	65	T	TT	27	29	93.10	M39b
21	66	G	T	29	29	100.00	M39b
22	72	T	C	81	83	97.59	HV0a
23	72	T	C	14	14	100.00	HV0b
24	72	T	C	12	14	85.71	HV0d
25	72	T	C	14	15	93.33	HV0e
26	72	T	C	11	12	91.67	V10a
27	72	T	C	12	14	85.71	V10b
28	72	T	C	12	14	85.71	V15a
29	72	T	C	14	15	93.33	V18a
30	72	T	C	101	124	81.45	V1a
31	72	T	C	13	15	86.67	V2b
32	72	T	C	8	10	80.00	V2c
33	72	T	C	16	17	94.12	V3a
34	72	T	C	70	83	84.34	V7a
35	72	T	G	15	15	100.00	H31a
36	73	A	G	23	23	100.00	A11a
37	73	A	G	12	12	100.00	A12a
38	73	A	G	13	13	100.00	A15a
39	73	A	G	56	56	100.00	A15c
40	73	A	G	13	13	100.00	A1a
41	73	A	G	224	272	82.35	A2a
42	73	A	G	46	46	100.00	A2b
43	73	A	G	21	25	84.00	A2d
44	73	A	G	18	19	94.74	A2f
45	73	A	G	11	13	84.62	A2g
46	73	A	G	16	19	84.21	A2h
47	73	A	G	16	17	94.12	A2i
48	73	A	G	9	10	90.00	A2j
49	73	A	G	11	11	100.00	A2k
50	73	A	G	13	13	100.00	A2l
51	73	A	G	10	10	100.00	A2m
52	73	A	G	14	15	93.33	A2p
53	73	A	G	23	24	95.83	A2q
54	73	A	G	11	11	100.00	A2u
55	73	A	G	11	11	100.00	A2v
56	73	A	G	28	28	100.00	A2w
57	73	A	G	14	15	93.33	A2y
58	73	A	G	66	66	100.00	A5a
59	73	A	G	23	23	100.00	A5b
60	73	A	G	10	10	100.00	A5c
61	73	A	G	22	22	100.00	A8a
62	73	A	G	44	47	93.62	B2a
63	73	A	G	232	234	99.15	B2b
64	73	A	G	44	46	95.65	B2c
65	73	A	G	34	34	100.00	B2d
66	73	A	G	31	32	96.88	B2e
67	73	A	G	14	15	93.33	B2g
68	73	A	G	33	33	100.00	B2i
69	73	A	G	19	19	100.00	B2l
70	73	A	G	26	26	100.00	B2o
71	73	A	G	24	24	100.00	B2q
72	73	A	G	15	16	93.75	B2y
73	73	A	G	2221	2227	99.73	B4a
74	73	A	G	282	286	98.60	B4b
75	73	A	G	286	288	99.31	B4c
76	73	A	G	40	40	100.00	B4d
77	73	A	G	22	22	100.00	B4e
78	73	A	G	46	47	97.87	B4g
79	73	A	G	18	18	100.00	B4h
80	73	A	G	11	11	100.00	B4i
81	73	A	G	539	539	100.00	B5a
82	73	A	G	165	166	99.40	B5b
83	73	A	G	71	72	98.61	B6a
84	73	A	G	132	136	97.06	C1b
85	73	A	G	51	58	87.93	C1c
86	73	A	G	143	145	98.62	C1d
87	73	A	G	444	445	99.78	C4a
88	73	A	G	226	226	100.00	C4b
89	73	A	G	30	33	90.91	C4c
90	73	A	G	70	70	100.00	C5a
91	73	A	G	43	43	100.00	C5b
92	73	A	G	34	36	94.44	C5c
93	73	A	G	31	32	96.88	C5d
94	73	A	G	156	157	99.36	C7a
95	73	A	G	22	27	81.48	D1a
96	73	A	G	19	20	95.00	D1e
97	73	A	G	50	52	96.15	D1f
98	73	A	G	36	36	100.00	D1g
99	73	A	G	36	37	97.30	D1j
100	73	A	G	64	64	100.00	D2a
101	73	A	G	22	22	100.00	D2b
102	73	A	G	162	163	99.39	D4a
103	73	A	G	277	279	99.28	D4b
104	73	A	G	79	79	100.00	D4c
105	73	A	G	183	183	100.00	D4e
106	73	A	G	16	16	100.00	D4f
107	73	A	G	81	82	98.78	D4g
108	73	A	G	118	118	100.00	D4h
109	73	A	G	44	44	100.00	D4i
110	73	A	G	303	304	99.67	D4j
111	73	A	G	34	34	100.00	D4m
112	73	A	G	18	18	100.00	D4n
113	73	A	G	57	57	100.00	D4o
114	73	A	G	12	12	100.00	D4p
115	73	A	G	27	27	100.00	D4q
116	73	A	G	13	13	100.00	D4s
117	73	A	G	220	222	99.10	D5a
118	73	A	G	160	162	98.77	D5b
119	73	A	G	24	24	100.00	D5c
120	73	A	G	20	20	100.00	D6a
121	73	A	G	13	13	100.00	D6c
122	73	A	G	376	380	98.95	E1a
123	73	A	G	49	49	100.00	E2a
124	73	A	G	32	32	100.00	E2b
125	73	A	G	741	747	99.20	F1a
126	73	A	G	145	146	99.32	F1b
127	73	A	G	50	50	100.00	F1c
128	73	A	G	49	49	100.00	F1d
129	73	A	G	31	31	100.00	F1e
130	73	A	G	149	149	100.00	F1f
131	73	A	G	79	79	100.00	F1g
132	73	A	G	71	71	100.00	F2a
133	73	A	G	28	28	100.00	F2b
134	73	A	G	13	13	100.00	F2c
135	73	A	G	16	16	100.00	F2d
136	73	A	G	10	10	100.00	F2f
137	73	A	G	79	79	100.00	F3a
138	73	A	G	225	226	99.56	F3b
139	73	A	G	36	36	100.00	F4a
140	73	A	G	82	83	98.80	F4b
141	73	A	G	82	82	100.00	G1a
142	73	A	G	68	68	100.00	G1b
143	73	A	G	15	15	100.00	G1c
144	73	A	G	252	253	99.60	G2a
145	73	A	G	50	50	100.00	G2b
146	73	A	G	10	10	100.00	G2c
147	73	A	G	37	39	94.87	G3a
148	73	A	G	18	18	100.00	G3b
149	73	A	G	53	53	100.00	HV2a
150	73	A	G	183	188	97.34	I1a
151	73	A	G	41	41	100.00	I1b
152	73	A	G	18	18	100.00	I1c
153	73	A	G	21	21	100.00	I1f
154	73	A	G	31	35	88.57	I2a
155	73	A	G	42	42	100.00	I2c
156	73	A	G	20	21	95.24	I2d
157	73	A	G	40	41	97.56	I3a
158	73	A	G	11	11	100.00	I3d
159	73	A	G	129	130	99.23	I4a
160	73	A	G	13	13	100.00	I4b
161	73	A	G	71	72	98.61	I5a
162	73	A	G	22	23	95.65	I5c
163	73	A	G	434	436	99.54	J1b
164	73	A	G	1543	1581	97.60	J1c
165	73	A	G	105	106	99.06	J1d
166	73	A	G	340	345	98.55	J2a
167	73	A	G	365	368	99.18	J2b
168	73	A	G	1168	1207	96.77	K1a
169	73	A	G	198	203	97.54	K1b
170	73	A	G	258	262	98.47	K1c
171	73	A	G	11	12	91.67	K1d
172	73	A	G	243	254	95.67	K2a
173	73	A	G	95	101	94.06	K2b
174	73	A	G	806	814	99.02	L0d
175	73	A	G	120	120	100.00	L0k
176	73	A	G	269	288	93.40	L1b
177	73	A	G	543	563	96.45	L1c
178	73	A	G	1000	1039	96.25	L2a
179	73	A	G	95	102	93.14	L2b
180	73	A	G	126	130	96.92	L2c
181	73	A	G	22	24	91.67	L2d
182	73	A	G	15	17	88.24	L2e
183	73	A	G	29	29	100.00	L3a
184	73	A	G	382	398	95.98	L3b
185	73	A	G	379	396	95.71	L3d
186	73	A	G	851	880	96.70	L3e
187	73	A	G	258	260	99.23	L3f
188	73	A	G	65	70	92.86	L3h
189	73	A	G	34	37	91.89	L3i
190	73	A	G	18	19	94.74	L3k
191	73	A	G	41	41	100.00	L3x
192	73	A	G	19	20	95.00	L4a
193	73	A	G	88	91	96.70	L4b
194	73	A	G	27	29	93.10	L5a
195	73	A	G	58	58	100.00	M10a
196	73	A	G	20	20	100.00	M11a
197	73	A	G	9	10	90.00	M11b
198	73	A	G	64	64	100.00	M12a
199	73	A	G	44	44	100.00	M12b
200	73	A	G	41	41	100.00	M13a
201	73	A	G	13	13	100.00	M13b
202	73	A	G	17	17	100.00	M13c
203	73	A	G	20	20	100.00	M17a
204	73	A	G	39	39	100.00	M17c
205	73	A	G	16	16	100.00	M18a
206	73	A	G	178	181	98.34	M1a
207	73	A	G	33	33	100.00	M1b
208	73	A	G	33	33	100.00	M21a
209	73	A	G	49	49	100.00	M21b
210	73	A	G	24	25	96.00	M24a
211	73	A	G	18	18	100.00	M24b
212	73	A	G	49	49	100.00	M27a
213	73	A	G	66	66	100.00	M27b
214	73	A	G	29	29	100.00	M27c
215	73	A	G	56	56	100.00	M28a
216	73	A	G	132	133	99.25	M2a
217	73	A	G	102	103	99.03	M2b
218	73	A	G	10	10	100.00	M30b
219	73	A	G	14	14	100.00	M30c
220	73	A	G	14	14	100.00	M30d
221	73	A	G	24	24	100.00	M31a
222	73	A	G	10	10	100.00	M32a
223	73	A	G	152	153	99.35	M32c
224	73	A	G	42	42	100.00	M33a
225	73	A	G	18	18	100.00	M33b
226	73	A	G	21	21	100.00	M33c
227	73	A	G	32	32	100.00	M35a
228	73	A	G	56	58	96.55	M35b
229	73	A	G	27	28	96.43	M36d
230	73	A	G	10	11	90.91	M37e
231	73	A	G	29	29	100.00	M39b
232	73	A	G	88	89	98.88	M3a
233	73	A	G	45	45	100.00	M3c
234	73	A	G	29	29	100.00	M3d
235	73	A	G	28	28	100.00	M40a
236	73	A	G	21	23	91.30	M42a
237	73	A	G	17	18	94.44	M42b
238	73	A	G	11	11	100.00	M44a
239	73	A	G	19	19	100.00	M45a
240	73	A	G	16	16	100.00	M49a
241	73	A	G	14	14	100.00	M49c
242	73	A	G	16	16	100.00	M4a
243	73	A	G	13	13	100.00	M50a
244	73	A	G	43	44	97.73	M51a
245	73	A	G	31	31	100.00	M52a
246	73	A	G	20	20	100.00	M52b
247	73	A	G	24	24	100.00	M53b
248	73	A	G	136	139	97.84	M5a
249	73	A	G	29	29	100.00	M5b
250	73	A	G	17	18	94.44	M5c
251	73	A	G	10	10	100.00	M60a
252	73	A	G	18	18	100.00	M62b
253	73	A	G	26	27	96.30	M65a
254	73	A	G	25	25	100.00	M68a
255	73	A	G	13	13	100.00	M69a
256	73	A	G	21	21	100.00	M6a
257	73	A	G	42	43	97.67	M71a
258	73	A	G	14	14	100.00	M72a
259	73	A	G	32	32	100.00	M74a
260	73	A	G	66	66	100.00	M74b
261	73	A	G	105	106	99.06	M7a
262	73	A	G	653	656	99.54	M7b
263	73	A	G	768	773	99.35	M7c
264	73	A	G	95	97	97.94	M8a
265	73	A	G	18	18	100.00	M91a
266	73	A	G	311	313	99.36	M9a
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1052	263	A	G	83	83	100.00	HV0a
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3273	2768	A	G	33	33	100.00	Q3a
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5461	8701	A	G	13	13	100.00	D6c
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6181	9221	A	G	1032	1039	99.33	L2a
6182	9221	A	G	101	102	99.02	L2b
6183	9221	A	G	130	130	100.00	L2c
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6653	10398	A	G	1036	1039	99.71	L2a
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6655	10398	A	G	129	130	99.23	L2c
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6660	10398	A	G	393	396	99.24	L3d
6661	10398	A	G	759	880	86.25	L3e
6662	10398	A	G	260	260	100.00	L3f
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