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Markers Found at ≥80% in Haplogroups (Ltr-Num-Ltr Level)

Data retrieved from sequences collected from Genbank on 2024-1-26
Number of unique variants below = 1545
Minimum haplogroup size for reporting = 10 sequences

There are twelve high frequency ancestral variants in this list that are extremely common across all lineages and, as such, are not generally informative for haplotyping. Conversely, the lack of one or more of these variants may be of use. These variants are 73G, 263G, 750G, 1438G, 2706G, 4769G, 7028T, 8860G, 11719A, 14766T, 15326G, & 16519C. For lineage distribution, see TopVariants.

Index	Pos	rCRS	Variant	Count	HG Total	Freq	Haplo
1	55	T	C	61	75	81.33	H15a
2	56	A	-	27	30	90.00	M39b
3	58	T	A	30	30	100.00	M39b
4	61	C	A	14	17	82.35	M13c
5	61	C	T	28	32	87.50	Q3a
6	62	G	A	14	17	82.35	M13c
7	62	G	A	28	32	87.50	Q3a
8	64	C	T	22	23	95.65	A2f
9	64	C	T	28	31	90.32	A2h
10	64	C	T	18	19	94.74	A2i
11	64	C	T	10	12	83.33	A2j
12	64	C	T	12	13	92.31	A2k
13	64	C	T	13	14	92.86	A2l
14	64	C	T	9	10	90.00	A2n
15	64	C	T	14	16	87.50	A2p
16	64	C	T	25	27	92.59	A2q
17	64	C	T	20	20	100.00	A2v
18	64	C	T	30	34	88.24	A2w
19	64	C	T	12	15	80.00	A2y
20	64	C	T	21	22	95.45	A8a
21	64	C	T	274	289	94.81	R0a
22	65	T	TT	28	30	93.33	M39b
23	66	G	T	30	30	100.00	M39b
24	72	T	C	82	86	95.35	HV0a
25	72	T	C	14	14	100.00	HV0b
26	72	T	C	13	15	86.67	HV0d
27	72	T	C	14	16	87.50	HV0e
28	72	T	C	12	13	92.31	V10a
29	72	T	C	13	15	86.67	V10b
30	72	T	C	11	13	84.62	V15a
31	72	T	C	18	19	94.74	V18a
32	72	T	C	107	130	82.31	V1a
33	72	T	C	15	17	88.24	V2b
34	72	T	C	9	11	81.82	V2c
35	72	T	C	20	21	95.24	V3a
36	72	T	C	76	91	83.52	V7a
37	72	T	G	15	15	100.00	H31a
38	73	A	G	29	29	100.00	A11a
39	73	A	G	11	11	100.00	A12a
40	73	A	G	13	13	100.00	A15a
41	73	A	G	57	57	100.00	A15c
42	73	A	G	13	13	100.00	A1a
43	73	A	G	250	298	83.89	A2a
44	73	A	G	54	54	100.00	A2b
45	73	A	G	27	31	87.10	A2d
46	73	A	G	22	23	95.65	A2f
47	73	A	G	16	18	88.89	A2g
48	73	A	G	28	31	90.32	A2h
49	73	A	G	18	19	94.74	A2i
50	73	A	G	11	12	91.67	A2j
51	73	A	G	13	13	100.00	A2k
52	73	A	G	14	14	100.00	A2l
53	73	A	G	12	12	100.00	A2m
54	73	A	G	9	10	90.00	A2n
55	73	A	G	15	16	93.75	A2p
56	73	A	G	26	27	96.30	A2q
57	73	A	G	12	12	100.00	A2u
58	73	A	G	20	20	100.00	A2v
59	73	A	G	34	34	100.00	A2w
60	73	A	G	14	15	93.33	A2y
61	73	A	G	70	70	100.00	A5a
62	73	A	G	25	25	100.00	A5b
63	73	A	G	10	10	100.00	A5c
64	73	A	G	22	22	100.00	A8a
65	73	A	G	62	65	95.38	B2a
66	73	A	G	244	246	99.19	B2b
67	73	A	G	54	56	96.43	B2c
68	73	A	G	35	35	100.00	B2d
69	73	A	G	34	35	97.14	B2e
70	73	A	G	15	16	93.75	B2g
71	73	A	G	11	11	100.00	B2h
72	73	A	G	34	34	100.00	B2i
73	73	A	G	19	19	100.00	B2l
74	73	A	G	30	30	100.00	B2o
75	73	A	G	25	25	100.00	B2q
76	73	A	G	16	17	94.12	B2y
77	73	A	G	2236	2240	99.82	B4a
78	73	A	G	283	286	98.95	B4b
79	73	A	G	301	303	99.34	B4c
80	73	A	G	42	42	100.00	B4d
81	73	A	G	22	22	100.00	B4e
82	73	A	G	50	51	98.04	B4g
83	73	A	G	20	20	100.00	B4h
84	73	A	G	11	11	100.00	B4i
85	73	A	G	555	555	100.00	B5a
86	73	A	G	168	169	99.41	B5b
87	73	A	G	71	72	98.61	B6a
88	73	A	G	153	157	97.45	C1b
89	73	A	G	61	68	89.71	C1c
90	73	A	G	156	158	98.73	C1d
91	73	A	G	457	460	99.35	C4a
92	73	A	G	273	273	100.00	C4b
93	73	A	G	31	35	88.57	C4c
94	73	A	G	93	93	100.00	C5a
95	73	A	G	44	44	100.00	C5b
96	73	A	G	35	37	94.59	C5c
97	73	A	G	38	39	97.44	C5d
98	73	A	G	163	164	99.39	C7a
99	73	A	G	22	27	81.48	D1a
100	73	A	G	18	19	94.74	D1e
101	73	A	G	51	53	96.23	D1f
102	73	A	G	36	36	100.00	D1g
103	73	A	G	36	37	97.30	D1j
104	73	A	G	64	64	100.00	D2a
105	73	A	G	22	22	100.00	D2b
106	73	A	G	176	177	99.44	D4a
107	73	A	G	292	295	98.98	D4b
108	73	A	G	81	81	100.00	D4c
109	73	A	G	196	197	99.49	D4e
110	73	A	G	17	18	94.44	D4f
111	73	A	G	89	90	98.89	D4g
112	73	A	G	125	125	100.00	D4h
113	73	A	G	48	48	100.00	D4i
114	73	A	G	314	316	99.37	D4j
115	73	A	G	39	39	100.00	D4m
116	73	A	G	18	18	100.00	D4n
117	73	A	G	69	69	100.00	D4o
118	73	A	G	12	12	100.00	D4p
119	73	A	G	28	28	100.00	D4q
120	73	A	G	13	13	100.00	D4s
121	73	A	G	227	229	99.13	D5a
122	73	A	G	164	166	98.80	D5b
123	73	A	G	24	24	100.00	D5c
124	73	A	G	19	19	100.00	D6a
125	73	A	G	12	12	100.00	D6c
126	73	A	G	380	383	99.22	E1a
127	73	A	G	53	53	100.00	E2a
128	73	A	G	32	32	100.00	E2b
129	73	A	G	751	757	99.21	F1a
130	73	A	G	152	153	99.35	F1b
131	73	A	G	66	66	100.00	F1c
132	73	A	G	78	78	100.00	F1d
133	73	A	G	33	33	100.00	F1e
134	73	A	G	154	154	100.00	F1f
135	73	A	G	89	89	100.00	F1g
136	73	A	G	71	71	100.00	F2a
137	73	A	G	31	31	100.00	F2b
138	73	A	G	13	13	100.00	F2c
139	73	A	G	18	18	100.00	F2d
140	73	A	G	11	11	100.00	F2f
141	73	A	G	83	83	100.00	F3a
142	73	A	G	231	231	100.00	F3b
143	73	A	G	35	35	100.00	F4a
144	73	A	G	71	72	98.61	F4b
145	73	A	G	81	81	100.00	G1a
146	73	A	G	108	108	100.00	G1b
147	73	A	G	15	15	100.00	G1c
148	73	A	G	271	274	98.91	G2a
149	73	A	G	56	56	100.00	G2b
150	73	A	G	11	11	100.00	G2c
151	73	A	G	42	44	95.45	G3a
152	73	A	G	18	18	100.00	G3b
153	73	A	G	55	55	100.00	HV2a
154	73	A	G	208	213	97.65	I1a
155	73	A	G	42	42	100.00	I1b
156	73	A	G	21	21	100.00	I1c
157	73	A	G	18	18	100.00	I1f
158	73	A	G	32	35	91.43	I2a
159	73	A	G	43	43	100.00	I2c
160	73	A	G	20	21	95.24	I2d
161	73	A	G	47	48	97.92	I3a
162	73	A	G	14	14	100.00	I3d
163	73	A	G	131	132	99.24	I4a
164	73	A	G	14	14	100.00	I4b
165	73	A	G	71	72	98.61	I5a
166	73	A	G	23	24	95.83	I5c
167	73	A	G	463	466	99.36	J1b
168	73	A	G	1639	1675	97.85	J1c
169	73	A	G	105	106	99.06	J1d
170	73	A	G	427	432	98.84	J2a
171	73	A	G	374	377	99.20	J2b
172	73	A	G	1268	1306	97.09	K1a
173	73	A	G	212	217	97.70	K1b
174	73	A	G	267	271	98.52	K1c
175	73	A	G	12	13	92.31	K1d
176	73	A	G	254	265	95.85	K2a
177	73	A	G	101	107	94.39	K2b
178	73	A	G	795	803	99.00	L0d
179	73	A	G	120	120	100.00	L0k
180	73	A	G	331	350	94.57	L1b
181	73	A	G	598	618	96.76	L1c
182	73	A	G	1118	1157	96.63	L2a
183	73	A	G	126	133	94.74	L2b
184	73	A	G	147	151	97.35	L2c
185	73	A	G	25	27	92.59	L2d
186	73	A	G	20	22	90.91	L2e
187	73	A	G	30	30	100.00	L3a
188	73	A	G	423	438	96.58	L3b
189	73	A	G	418	434	96.31	L3d
190	73	A	G	949	977	97.13	L3e
191	73	A	G	290	292	99.32	L3f
192	73	A	G	74	79	93.67	L3h
193	73	A	G	33	36	91.67	L3i
194	73	A	G	20	20	100.00	L3k
195	73	A	G	43	43	100.00	L3x
196	73	A	G	19	20	95.00	L4a
197	73	A	G	88	91	96.70	L4b
198	73	A	G	28	30	93.33	L5a
199	73	A	G	67	67	100.00	M10a
200	73	A	G	21	21	100.00	M11a
201	73	A	G	9	10	90.00	M11b
202	73	A	G	67	67	100.00	M12a
203	73	A	G	44	44	100.00	M12b
204	73	A	G	44	44	100.00	M13a
205	73	A	G	13	13	100.00	M13b
206	73	A	G	17	17	100.00	M13c
207	73	A	G	20	20	100.00	M17a
208	73	A	G	39	39	100.00	M17c
209	73	A	G	18	18	100.00	M18a
210	73	A	G	189	192	98.44	M1a
211	73	A	G	47	48	97.92	M1b
212	73	A	G	34	34	100.00	M21a
213	73	A	G	51	51	100.00	M21b
214	73	A	G	26	27	96.30	M24a
215	73	A	G	18	18	100.00	M24b
216	73	A	G	49	49	100.00	M27a
217	73	A	G	66	66	100.00	M27b
218	73	A	G	29	29	100.00	M27c
219	73	A	G	56	56	100.00	M28a
220	73	A	G	136	137	99.27	M2a
221	73	A	G	104	105	99.05	M2b
222	73	A	G	11	11	100.00	M30b
223	73	A	G	15	15	100.00	M30c
224	73	A	G	14	14	100.00	M30d
225	73	A	G	24	24	100.00	M31a
226	73	A	G	10	10	100.00	M32a
227	73	A	G	149	149	100.00	M32c
228	73	A	G	44	44	100.00	M33a
229	73	A	G	17	17	100.00	M33b
230	73	A	G	21	21	100.00	M33c
231	73	A	G	32	32	100.00	M35a
232	73	A	G	60	62	96.77	M35b
233	73	A	G	27	28	96.43	M36d
234	73	A	G	11	12	91.67	M37e
235	73	A	G	30	30	100.00	M39b
236	73	A	G	96	97	98.97	M3a
237	73	A	G	47	47	100.00	M3c
238	73	A	G	32	32	100.00	M3d
239	73	A	G	28	28	100.00	M40a
240	73	A	G	18	20	90.00	M42a
241	73	A	G	18	19	94.74	M42b
242	73	A	G	11	11	100.00	M44a
243	73	A	G	19	19	100.00	M45a
244	73	A	G	16	16	100.00	M49a
245	73	A	G	13	13	100.00	M49c
246	73	A	G	16	16	100.00	M4a
247	73	A	G	14	14	100.00	M50a
248	73	A	G	42	43	97.67	M51a
249	73	A	G	29	29	100.00	M52a
250	73	A	G	19	19	100.00	M52b
251	73	A	G	24	24	100.00	M53b
252	73	A	G	157	160	98.12	M5a
253	73	A	G	30	30	100.00	M5b
254	73	A	G	18	19	94.74	M5c
255	73	A	G	10	10	100.00	M60a
256	73	A	G	22	22	100.00	M62b
257	73	A	G	26	27	96.30	M65a
258	73	A	G	10	10	100.00	M65b
259	73	A	G	25	25	100.00	M68a
260	73	A	G	13	13	100.00	M69a
261	73	A	G	24	24	100.00	M6a
262	73	A	G	43	44	97.73	M71a
263	73	A	G	16	16	100.00	M72a
264	73	A	G	33	33	100.00	M74a
265	73	A	G	67	67	100.00	M74b
266	73	A	G	105	106	99.06	M7a
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1047	263	A	G	16	16	100.00	H4b
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1049	263	A	G	46	46	100.00	H58a
1050	263	A	G	471	494	95.34	H5a
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1052	263	A	G	24	24	100.00	H5c
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1253	263	A	G	50	50	100.00	T2g
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1255	263	A	G	18	18	100.00	T2i
1256	263	A	G	15	15	100.00	T2k
1257	263	A	G	162	165	98.18	U1a
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1271	263	A	G	1243	1286	96.66	U5b
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1281	263	A	G	13	13	100.00	V10a
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1283	263	A	G	12	13	92.31	V15a
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1286	263	A	G	17	17	100.00	V2b
1287	263	A	G	10	11	90.91	V2c
1288	263	A	G	21	21	100.00	V3a
1289	263	A	G	16	16	100.00	V3c
1290	263	A	G	80	91	87.91	V7a
1291	263	A	G	27	27	100.00	V9a
1292	263	A	G	41	44	93.18	W1a
1293	263	A	G	24	26	92.31	W1b
1294	263	A	G	23	25	92.00	W1c
1295	263	A	G	25	27	92.59	W1e
1296	263	A	G	96	102	94.12	W3a
1297	263	A	G	43	43	100.00	W3b
1298	263	A	G	18	19	94.74	W4a
1299	263	A	G	42	46	91.30	W5a
1300	263	A	G	33	33	100.00	W6a
1301	263	A	G	10	10	100.00	X1c
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2783	1598	G	A	169	169	100.00	B5b
2784	1598	G	A	39	39	100.00	M17c
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3755	4715	A	G	39	39	100.00	C5d
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9710	15326	A	G	169	169	100.00	B5b
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10136	15452	C	A	431	432	99.77	J2a
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10151	15454	T	C	16	16	100.00	HV0e
10152	15454	T	C	164	165	99.39	U3a
10153	15454	T	C	241	241	100.00	U3b
10154	15454	T	C	10	11	90.91	U3c
10155	15458	T	C	44	44	100.00	M71a
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10157	15466	G	A	46	46	100.00	H58a
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10159	15468	C	T	13	13	100.00	M13b
10160	15475	A	G	26	26	100.00	Z4a
10161	15479	T	C	67	67	100.00	R9c
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10163	15487	A	T	68	68	100.00	C1c
10164	15487	A	T	158	158	100.00	C1d
10165	15487	A	T	457	460	99.35	C4a
10166	15487	A	T	273	273	100.00	C4b
10167	15487	A	T	35	35	100.00	C4c
10168	15487	A	T	93	93	100.00	C5a
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10170	15487	A	T	37	37	100.00	C5c
10171	15487	A	T	39	39	100.00	C5d
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10173	15487	A	T	105	106	99.06	M8a
10174	15487	A	T	108	108	100.00	Z1a
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10351	15944	T	-	266	292	91.10	L3f
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10376	16069	C	T	105	106	99.06	J1d
10377	16069	C	T	427	432	98.84	J2a
10378	16069	C	T	374	377	99.20	J2b
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10380	16071	C	T	16	16	100.00	R2d
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10384	16086	T	C	15	18	83.33	M24b
10385	16086	T	C	60	66	90.91	M27b
10386	16086	T	C	51	56	91.07	M28a
10387	16086	T	C	148	149	99.33	M32c
10388	16086	T	C	17	18	94.44	N3a
10389	16092	T	A	30	31	96.77	F2b
10390	16092	T	C	30	30	100.00	B2o
10391	16092	T	C	19	22	86.36	D2b
10392	16093	T	C	31	37	83.78	C5c
10393	16111	C	A	19	22	86.36	L2e
10394	16111	C	T	268	298	89.93	A2a
10395	16111	C	T	54	54	100.00	A2b
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10401	16111	C	T	12	13	92.31	A2k
10402	16111	C	T	15	16	93.75	A2p
10403	16111	C	T	26	27	96.30	A2q
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10621	16189	T	C	264	303	87.13	B4c
10622	16189	T	C	21	22	95.45	B4e
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11071	16278	C	T	27	27	100.00	X2d
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11087	16289	A	G	26	27	96.30	M65a
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11089	16290	C	T	11	11	100.00	A12a
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11097	16290	C	T	16	18	88.89	A2g
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11291	16311	T	C	52	52	100.00	R1a
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11293	16311	T	C	212	213	99.53	U6b
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11557	16519	T	C	22	22	100.00	B4e
11558	16519	T	C	49	51	96.08	B4g
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11786	16527	C	T	35	37	94.59	C5c